DNA親子鑒定是根據遺傳學原理,運用現時代的技術對DNA片段的特定提取檢測,并對結果進行相應的計算和分析,得出鑒定結論的過程。雖然現在的親子鑒定的技術是非常的成熟,但是還是會有一些特殊情況的情況出現,比如親子鑒定的基因突變,那么親子鑒定基因突變有哪些情況,說到基因突變,有沒有基因型鑒定方法呢,以及其鑒定優缺點,跟著小編一起來看看
親子鑒定基因突變兩大情況:
產生基因突變有兩種情況,一種是親代將DNA傳遞給孩子的過程中,發生的突變,這是實際存在的突變;這種突變,盡管父母親都可能發生,但是前文也曾提到過,形成受精卵的時候,是精子的頭部與完整的卵細胞結合,所以精子中的DNA不如卵子穩定,與卵細胞相比,較容易發生突變,
一種雖然稱之為突變,只是在實驗過程中,由于某種試 劑盒或酶而產生的實驗系統誤差,也就是說只要使用同一種試劑 盒,無論誰做這樣的樣本,或者是采用不同的樣本,做出來的結 果都存在這樣的系統誤差。因為從結果來看,顯示的是父子有一 個位點不一致,所以也稱為突變,實際應該是系統誤差。這種情 況可以換一種試劑盒或者換一種酶,系統誤差是可以排除或者避 免的。但是這種情況,也是在實際檢案中發現和解決的,不經檢 測或者不換試劑盒檢測,是發現不了的。
基因突變會影響親子鑒定結果嗎?
基因突變不會影響結果的準確率,這種突變在親子鑒定中可以允許<3個位點的存在,如果鑒定雙方有<3個基因位點差異,可以通過增加檢測位點數使準確度達到99.9999%以上?;蛲蛔兪遣粫绊懡Y果的準確率。在一定的條件下基因也可以從原來的存在形式突然改變成另一種新的存在形式,就是在一個位點上,突然出現了一個新基因
基因型鑒定方法有哪些?
1.二代測序+IGV觀察/callSNP軟件分析
原理:設計多種標簽序列(F向和R向)組合,使不同的組合對應不同的樣本,根據測序輸出的reads上的標簽序列對測序結果中的樣本進行區分,一次測序獲得多個樣本數據,且測序數據量不用太高,1-2G即可,最后根據測序結果與參考序列匹配情況和reads比例判斷突變類型和純合雜合情況;
優點:通量高,單個樣本成本低,能夠分辨單個位點存在的多種突變類型;
缺點:結果反饋速度慢,一般需要兩周左右才能拿到結果,不適合小樣本量的檢測。
2.測序文件的一代測序+DSDEcodeM分析。
原理:軟件根據測序的信號峰雙峰嵌套位置和強弱判斷突變類型;
優點:速度快,一代測序結果一般第二天能得到,軟件分析迅速;
缺點:單個樣本成本高,不適合大樣本量檢測,位點存在兩種以上的突變類型時,測序峰雜亂,手動和軟件均不能很好的區分。
3.KASP
原理:用不同的熒光標記不同的引物(兩種引物末端有1個SNP變異),PCR延伸后發出不同的熒光,根據熒光值判斷基因型;
優點:檢測速度快(擴增時間短),通量高(qPCR儀一次可96板);
缺點:試劑成本高,儀器設備較貴,只適用于檢測單位點SNP變異,不能清晰的知道序列變異情況,適用范圍較窄。
4.dCAPs
原理:在已知序列變異的情況下,利用突變形成的酶切位點對突變位點的PCR擴增產物進行進行酶切檢測,根據酶切結果判斷突變情況。
優點:成本低(單個樣本僅需0.1ul酶即可),通量大(可以同時對具有同類突變的大量樣本進行檢測),周期短(PCR擴增加酶切后電泳1天可完成);
缺點:需要已知突變位點的序列情況才可選擇合適的內切酶,有的內切酶可能不常見。
5.SSR分析
原理:根據條帶大小的不同分析基因型;
優點:檢測速度快,通量高,能夠檢測最低1bp的長度差異(推薦3bp以上);
缺點:試劑成本較高(使用專業分析儀),只適合檢測已知存在堿基缺失的突變位點。
基因型鑒定的原理
22對常染色體和1對性染色體(包括1條X染色體和1條Y染色體)是人類基因組的組成部分。人類基因組含31.6億個DNA堿基對,染色體由DNA和核糖體蛋白組成。單核苷酸多態性是指單核苷酸的多態性,又稱SNP,是一種具有相同堿基的單核苷酸,對人體的遺傳特性有一定的影響。目前,人體DNA的大部分差異是SNP上的差異。這種差異約為人體DNA堿基總量的0.5%。目前,基于SNP的研究報告中有很大一部分是基于SNP的。
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