雙胞胎之間鑒定的是親緣關系，一般是鑒定同父同母的兄弟或者姐妹。鑒定對比常染色體STR（至少39個基因座）+(Y-STR)+線粒體+全同胞指數計算；鑒定的準確率為99.9999%，無法確定的概率為5%。當雙胞胎為兄妹、姐弟時鑒定準確率為99.9999%，無法確定的概率為1%。親緣關系的鑒定難度大于一般的親子關系，收費會比一般的親子鑒定要高；也可以通過親子鑒定的方式間接的確定雙胞胎之間的親緣關系。
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